Ο Ιωάννης Βίρλος ειδικεύεται στη Λαπαροσκοπική Χειρουργική των παθήσεων του εντέρου και του ορθού, όπως:
Λαπαροσκοπική κολεκτομή ή Λαπαροσκοπική εκτομή του παχέος εντέρου για καρκίνο,
Λαπαροσκοπική κολεκτομή για χρόνιες φλεγμονώδεις νόσους του παχέος και λεπτού εντέρου (όπως ελκώδης κολίτιδα & νόσος του Crohn’s)
Λαπαροσκοπική κολεκτομή για εκκολπωματική νόσο του παχέος εντέρου
Λαπαροσκοπική ολική εκτομή του ορθού και του μεσο-ορθού (Total Mesorectal Excision -TME) για καρκίνο του ορθού
Διορθική Εκτομή Πρώϊμων Όγκων Ορθού με δημιουργία πνευμοκόλου (πνευμο-ορθού) και με ελάχιστα επεμβατικές μεθόδους διαμέσου φυσικού στομίου (Transanal Minimal Invasive Surgery - TAMIS), οι οποίες διατηρούν το ορθό (rectum sparing techniques)
Διασφηγκτηριακές εκτομές (intersphincteric resection) για καρκίνο του ορθού, οι οποίες διατηρούν τους σφιγκτήρες του πρωκτού (sphincter saving techniques)
Διορθική Ολική Εκτομή του ορθού και του μεσο-ορθού με δημιουργία πνευμοκόλου και διαμέσου φυσικού στομίου με δημιουργία πνευμοκόλου και ελάχιστα επεμβατικές μεθόδους (NOTES - Transanal TME )
Λαπαροσκοπική ολική εκτομή του παχέος εντέρου και ορθού (πρωκτο-κολεκτομή) με δημιουργία ληκύθου (pouch) για ελκώδη κολίτιδα
Επεμβάσεις για μεταστατικό καρκίνο του παχέος εντέρου
Επεμβάσεις για περίπλοκα συρίγγια εντέρου και αποστήματα της κοιλιακής χώρας
Λαπαροσκοπική εκτομή του λεπτού εντέρου
Επεμβάσεις πρωκτικής χώρας, συμπεριλαμβανομένων επεμβάσεων για συρίγγια, ραγάδες, και επεμβάσεις για αιμορροΐδες (HALO)
Επεμβάσεις για κύστη κόκκυγος
Επίσης ο Ιωάννης Βίρλος ειδικεύεται σε επεμβάσεις γενικής χειρουργικής όπως:
Λαπαροσκοπική χολοκυστεκτομή
Χειρουργική κηλών (βουβωνοκήλη / ομφαλοκήλη/ μηροκήλη/ μετεγχειρητική κοιλιοκήλη/ επιγαστρική κήλη)
Λαπαροσκοπική σκωληκοειδεκτομή
Λαπαροσκοπική συρραφή διατηρηθέντος έλκους 12δακτύλου
Λαπαροτομία
Σπληνεκτομή
Γαστρεκτομή
Διαγνωστική λαπαροσκόπηση